Amado Guevara (considerado por Conmebol como el mejor jugador del continente americano en 2001) surgió de las divisiones menores de Motagua, ajax fc tuvo cuatro etapas en el club y acumuló un total de 279 partidos disputados. Para el inicio de la temporada 2013-14 el club fichó a Luis Enrique como nuevo entrenador. Único club hondureño que disputó la Copa de Gigantes de la Concacaf.
